Protein–RNA interactions for Protein: Q60676

Ppp5c, Serine/threonine-protein phosphatase 5, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp5cQ60676 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppp5cQ60676 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ppp5cQ60676 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppp5cQ60676 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppp5cQ60676 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppp5cQ60676 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppp5cQ60676 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms