Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HnrnpdQ60668 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HnrnpdQ60668 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HnrnpdQ60668 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HnrnpdQ60668 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HnrnpdQ60668 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HnrnpdQ60668 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HnrnpdQ60668 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HnrnpdQ60668 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HnrnpdQ60668 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HnrnpdQ60668 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HnrnpdQ60668 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HnrnpdQ60668 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HnrnpdQ60668 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HnrnpdQ60668 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HnrnpdQ60668 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HnrnpdQ60668 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HnrnpdQ60668 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HnrnpdQ60668 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HnrnpdQ60668 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HnrnpdQ60668 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HnrnpdQ60668 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HnrnpdQ60668 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HnrnpdQ60668 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HnrnpdQ60668 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HnrnpdQ60668 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HnrnpdQ60668 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HnrnpdQ60668 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HnrnpdQ60668 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HnrnpdQ60668 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HnrnpdQ60668 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HnrnpdQ60668 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HnrnpdQ60668 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HnrnpdQ60668 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HnrnpdQ60668 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HnrnpdQ60668 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HnrnpdQ60668 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HnrnpdQ60668 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HnrnpdQ60668 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HnrnpdQ60668 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HnrnpdQ60668 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HnrnpdQ60668 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HnrnpdQ60668 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HnrnpdQ60668 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HnrnpdQ60668 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HnrnpdQ60668 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HnrnpdQ60668 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HnrnpdQ60668 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HnrnpdQ60668 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HnrnpdQ60668 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HnrnpdQ60668 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HnrnpdQ60668 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HnrnpdQ60668 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HnrnpdQ60668 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HnrnpdQ60668 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HnrnpdQ60668 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HnrnpdQ60668 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HnrnpdQ60668 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HnrnpdQ60668 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HnrnpdQ60668 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HnrnpdQ60668 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HnrnpdQ60668 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HnrnpdQ60668 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HnrnpdQ60668 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HnrnpdQ60668 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HnrnpdQ60668 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HnrnpdQ60668 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HnrnpdQ60668 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HnrnpdQ60668 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HnrnpdQ60668 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HnrnpdQ60668 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HnrnpdQ60668 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HnrnpdQ60668 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HnrnpdQ60668 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HnrnpdQ60668 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HnrnpdQ60668 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HnrnpdQ60668 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HnrnpdQ60668 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HnrnpdQ60668 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms