Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms