Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MALRD1Q5VYJ5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MALRD1Q5VYJ5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MALRD1Q5VYJ5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MALRD1Q5VYJ5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MALRD1Q5VYJ5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MALRD1Q5VYJ5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MALRD1Q5VYJ5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MALRD1Q5VYJ5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MALRD1Q5VYJ5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MALRD1Q5VYJ5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MALRD1Q5VYJ5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MALRD1Q5VYJ5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MALRD1Q5VYJ5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MALRD1Q5VYJ5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MALRD1Q5VYJ5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MALRD1Q5VYJ5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MALRD1Q5VYJ5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MALRD1Q5VYJ5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MALRD1Q5VYJ5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MALRD1Q5VYJ5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MALRD1Q5VYJ5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MALRD1Q5VYJ5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MALRD1Q5VYJ5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MALRD1Q5VYJ5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MALRD1Q5VYJ5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
MALRD1Q5VYJ5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MALRD1Q5VYJ5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms