Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
WDR78Q5VTH9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
WDR78Q5VTH9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
WDR78Q5VTH9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
WDR78Q5VTH9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
WDR78Q5VTH9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
WDR78Q5VTH9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
WDR78Q5VTH9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
WDR78Q5VTH9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
WDR78Q5VTH9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
WDR78Q5VTH9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
WDR78Q5VTH9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
WDR78Q5VTH9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
WDR78Q5VTH9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
WDR78Q5VTH9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
WDR78Q5VTH9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
WDR78Q5VTH9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
WDR78Q5VTH9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
WDR78Q5VTH9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
WDR78Q5VTH9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
WDR78Q5VTH9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
WDR78Q5VTH9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
WDR78Q5VTH9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
WDR78Q5VTH9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
WDR78Q5VTH9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
WDR78Q5VTH9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
WDR78Q5VTH9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
WDR78Q5VTH9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
WDR78Q5VTH9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
WDR78Q5VTH9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
WDR78Q5VTH9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
WDR78Q5VTH9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
WDR78Q5VTH9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
WDR78Q5VTH9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
WDR78Q5VTH9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
WDR78Q5VTH9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
WDR78Q5VTH9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
WDR78Q5VTH9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
WDR78Q5VTH9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
WDR78Q5VTH9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
WDR78Q5VTH9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
WDR78Q5VTH9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
WDR78Q5VTH9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
WDR78Q5VTH9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
WDR78Q5VTH9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
WDR78Q5VTH9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
WDR78Q5VTH9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
WDR78Q5VTH9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
WDR78Q5VTH9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms