Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CROCCQ5TZA2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CROCCQ5TZA2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCCQ5TZA2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms