Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDSS1Q5T2R2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDSS1Q5T2R2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDSS1Q5T2R2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDSS1Q5T2R2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDSS1Q5T2R2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDSS1Q5T2R2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDSS1Q5T2R2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDSS1Q5T2R2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDSS1Q5T2R2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDSS1Q5T2R2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDSS1Q5T2R2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PDSS1Q5T2R2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDSS1Q5T2R2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDSS1Q5T2R2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDSS1Q5T2R2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDSS1Q5T2R2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDSS1Q5T2R2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDSS1Q5T2R2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDSS1Q5T2R2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDSS1Q5T2R2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDSS1Q5T2R2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDSS1Q5T2R2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDSS1Q5T2R2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDSS1Q5T2R2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDSS1Q5T2R2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDSS1Q5T2R2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDSS1Q5T2R2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDSS1Q5T2R2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDSS1Q5T2R2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDSS1Q5T2R2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDSS1Q5T2R2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDSS1Q5T2R2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDSS1Q5T2R2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDSS1Q5T2R2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDSS1Q5T2R2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDSS1Q5T2R2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDSS1Q5T2R2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDSS1Q5T2R2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms