Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2Q4

CCNYL2, Cyclin-Y-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL2Q5T2Q4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNYL2Q5T2Q4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNYL2Q5T2Q4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNYL2Q5T2Q4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNYL2Q5T2Q4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNYL2Q5T2Q4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNYL2Q5T2Q4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNYL2Q5T2Q4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNYL2Q5T2Q4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNYL2Q5T2Q4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNYL2Q5T2Q4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNYL2Q5T2Q4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNYL2Q5T2Q4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNYL2Q5T2Q4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNYL2Q5T2Q4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNYL2Q5T2Q4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNYL2Q5T2Q4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNYL2Q5T2Q4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNYL2Q5T2Q4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNYL2Q5T2Q4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNYL2Q5T2Q4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNYL2Q5T2Q4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CCNYL2Q5T2Q4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNYL2Q5T2Q4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNYL2Q5T2Q4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNYL2Q5T2Q4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNYL2Q5T2Q4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNYL2Q5T2Q4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNYL2Q5T2Q4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNYL2Q5T2Q4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNYL2Q5T2Q4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNYL2Q5T2Q4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNYL2Q5T2Q4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNYL2Q5T2Q4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNYL2Q5T2Q4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNYL2Q5T2Q4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNYL2Q5T2Q4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNYL2Q5T2Q4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNYL2Q5T2Q4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNYL2Q5T2Q4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNYL2Q5T2Q4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNYL2Q5T2Q4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNYL2Q5T2Q4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms