Protein–RNA interactions for Protein: Q5T160

RARS2, Probable arginine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARS2Q5T160 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RARS2Q5T160 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RARS2Q5T160 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RARS2Q5T160 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RARS2Q5T160 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RARS2Q5T160 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RARS2Q5T160 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RARS2Q5T160 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RARS2Q5T160 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RARS2Q5T160 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RARS2Q5T160 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RARS2Q5T160 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RARS2Q5T160 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RARS2Q5T160 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RARS2Q5T160 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RARS2Q5T160 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RARS2Q5T160 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RARS2Q5T160 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RARS2Q5T160 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RARS2Q5T160 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RARS2Q5T160 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RARS2Q5T160 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RARS2Q5T160 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RARS2Q5T160 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RARS2Q5T160 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RARS2Q5T160 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RARS2Q5T160 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RARS2Q5T160 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RARS2Q5T160 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RARS2Q5T160 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RARS2Q5T160 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RARS2Q5T160 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RARS2Q5T160 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RARS2Q5T160 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RARS2Q5T160 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RARS2Q5T160 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RARS2Q5T160 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RARS2Q5T160 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RARS2Q5T160 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RARS2Q5T160 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARS2Q5T160 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARS2Q5T160 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARS2Q5T160 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARS2Q5T160 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARS2Q5T160 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARS2Q5T160 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARS2Q5T160 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARS2Q5T160 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARS2Q5T160 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RARS2Q5T160 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARS2Q5T160 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARS2Q5T160 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARS2Q5T160 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARS2Q5T160 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARS2Q5T160 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARS2Q5T160 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARS2Q5T160 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARS2Q5T160 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARS2Q5T160 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARS2Q5T160 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARS2Q5T160 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARS2Q5T160 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARS2Q5T160 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARS2Q5T160 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RARS2Q5T160 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RARS2Q5T160 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RARS2Q5T160 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms