Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXG7

Vmo1, Vitelline membrane outer layer protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmo1Q5SXG7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmo1Q5SXG7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmo1Q5SXG7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmo1Q5SXG7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmo1Q5SXG7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmo1Q5SXG7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmo1Q5SXG7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmo1Q5SXG7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmo1Q5SXG7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmo1Q5SXG7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmo1Q5SXG7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmo1Q5SXG7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmo1Q5SXG7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmo1Q5SXG7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmo1Q5SXG7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmo1Q5SXG7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmo1Q5SXG7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmo1Q5SXG7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmo1Q5SXG7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmo1Q5SXG7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmo1Q5SXG7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmo1Q5SXG7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmo1Q5SXG7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmo1Q5SXG7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms