Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Myh1Q5SX40 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Myh1Q5SX40 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Myh1Q5SX40 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Myh1Q5SX40 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Myh1Q5SX40 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Myh1Q5SX40 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Myh1Q5SX40 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Myh1Q5SX40 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Myh1Q5SX40 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Myh1Q5SX40 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Myh1Q5SX40 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Myh1Q5SX40 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Myh1Q5SX40 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Myh1Q5SX40 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Myh1Q5SX40 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Myh1Q5SX40 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Myh1Q5SX40 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Myh1Q5SX40 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Myh1Q5SX40 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Myh1Q5SX40 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Myh1Q5SX40 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Myh1Q5SX40 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Myh1Q5SX40 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Myh1Q5SX40 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Myh1Q5SX40 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Myh1Q5SX40 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Myh1Q5SX40 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Myh1Q5SX40 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Myh1Q5SX40 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Myh1Q5SX40 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Myh1Q5SX40 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Myh1Q5SX40 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Myh1Q5SX40 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Myh1Q5SX40 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Myh1Q5SX40 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Myh1Q5SX40 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Myh1Q5SX40 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Myh1Q5SX40 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Myh1Q5SX40 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Myh1Q5SX40 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Myh1Q5SX40 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Myh1Q5SX40 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Myh1Q5SX40 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Myh1Q5SX40 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Myh1Q5SX40 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Myh1Q5SX40 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Myh1Q5SX40 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Myh1Q5SX40 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Myh1Q5SX40 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Myh1Q5SX40 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Myh1Q5SX40 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Myh1Q5SX40 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Myh1Q5SX40 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Myh1Q5SX40 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Myh1Q5SX40 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Myh1Q5SX40 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Myh1Q5SX40 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Myh1Q5SX40 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Myh1Q5SX40 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Myh1Q5SX40 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Myh1Q5SX40 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Myh1Q5SX40 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Myh1Q5SX40 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Myh1Q5SX40 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Myh1Q5SX40 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Myh1Q5SX40 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Myh1Q5SX40 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Myh1Q5SX40 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Myh1Q5SX40 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Myh1Q5SX40 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Myh1Q5SX40 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Myh1Q5SX40 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Myh1Q5SX40 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Myh1Q5SX40 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Myh1Q5SX40 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Myh1Q5SX40 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Myh1Q5SX40 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Myh1Q5SX40 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Myh1Q5SX40 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Myh1Q5SX40 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Myh1Q5SX40 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Myh1Q5SX40 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Myh1Q5SX40 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Myh1Q5SX40 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Myh1Q5SX40 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Myh1Q5SX40 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Myh1Q5SX40 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Myh1Q5SX40 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Myh1Q5SX40 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Myh1Q5SX40 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Myh1Q5SX40 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Myh1Q5SX40 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Myh1Q5SX40 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Myh1Q5SX40 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Myh1Q5SX40 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Myh1Q5SX40 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Myh1Q5SX40 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Myh1Q5SX40 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Myh1Q5SX40 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms