Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc42Q5SV66 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc42Q5SV66 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc42Q5SV66 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc42Q5SV66 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc42Q5SV66 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc42Q5SV66 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc42Q5SV66 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc42Q5SV66 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc42Q5SV66 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc42Q5SV66 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc42Q5SV66 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc42Q5SV66 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc42Q5SV66 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc42Q5SV66 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc42Q5SV66 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc42Q5SV66 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc42Q5SV66 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc42Q5SV66 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc42Q5SV66 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc42Q5SV66 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc42Q5SV66 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc42Q5SV66 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc42Q5SV66 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc42Q5SV66 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc42Q5SV66 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc42Q5SV66 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc42Q5SV66 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc42Q5SV66 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc42Q5SV66 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc42Q5SV66 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc42Q5SV66 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc42Q5SV66 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc42Q5SV66 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc42Q5SV66 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc42Q5SV66 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc42Q5SV66 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc42Q5SV66 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc42Q5SV66 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc42Q5SV66 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc42Q5SV66 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc42Q5SV66 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc42Q5SV66 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc42Q5SV66 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc42Q5SV66 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc42Q5SV66 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc42Q5SV66 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc42Q5SV66 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc42Q5SV66 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc42Q5SV66 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc42Q5SV66 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc42Q5SV66 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc42Q5SV66 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc42Q5SV66 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc42Q5SV66 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc42Q5SV66 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc42Q5SV66 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc42Q5SV66 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc42Q5SV66 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc42Q5SV66 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc42Q5SV66 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc42Q5SV66 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc42Q5SV66 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc42Q5SV66 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc42Q5SV66 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc42Q5SV66 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc42Q5SV66 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc42Q5SV66 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc42Q5SV66 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc42Q5SV66 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc42Q5SV66 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc42Q5SV66 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc42Q5SV66 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc42Q5SV66 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms