Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Psme4Q5SSW2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Psme4Q5SSW2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Psme4Q5SSW2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Psme4Q5SSW2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Psme4Q5SSW2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Psme4Q5SSW2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Psme4Q5SSW2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Psme4Q5SSW2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psme4Q5SSW2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Psme4Q5SSW2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Psme4Q5SSW2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Psme4Q5SSW2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Psme4Q5SSW2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Psme4Q5SSW2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Psme4Q5SSW2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Psme4Q5SSW2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psme4Q5SSW2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psme4Q5SSW2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psme4Q5SSW2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Psme4Q5SSW2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Psme4Q5SSW2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Psme4Q5SSW2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Psme4Q5SSW2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Psme4Q5SSW2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Psme4Q5SSW2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Psme4Q5SSW2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Psme4Q5SSW2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Psme4Q5SSW2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Psme4Q5SSW2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Psme4Q5SSW2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Psme4Q5SSW2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Psme4Q5SSW2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Psme4Q5SSW2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Psme4Q5SSW2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Psme4Q5SSW2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Psme4Q5SSW2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Psme4Q5SSW2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Psme4Q5SSW2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Psme4Q5SSW2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Psme4Q5SSW2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Psme4Q5SSW2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Psme4Q5SSW2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Psme4Q5SSW2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Psme4Q5SSW2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Psme4Q5SSW2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Psme4Q5SSW2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Psme4Q5SSW2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Psme4Q5SSW2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Psme4Q5SSW2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Psme4Q5SSW2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Psme4Q5SSW2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Psme4Q5SSW2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Psme4Q5SSW2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Psme4Q5SSW2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Psme4Q5SSW2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Psme4Q5SSW2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Psme4Q5SSW2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Psme4Q5SSW2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Psme4Q5SSW2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Psme4Q5SSW2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Psme4Q5SSW2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Psme4Q5SSW2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Psme4Q5SSW2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Psme4Q5SSW2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Psme4Q5SSW2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Psme4Q5SSW2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Psme4Q5SSW2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Psme4Q5SSW2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Psme4Q5SSW2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Psme4Q5SSW2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Psme4Q5SSW2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Psme4Q5SSW2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms