Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phf12Q5SPL2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Phf12Q5SPL2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Phf12Q5SPL2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phf12Q5SPL2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Phf12Q5SPL2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phf12Q5SPL2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phf12Q5SPL2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phf12Q5SPL2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phf12Q5SPL2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phf12Q5SPL2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phf12Q5SPL2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf12Q5SPL2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf12Q5SPL2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf12Q5SPL2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf12Q5SPL2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf12Q5SPL2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf12Q5SPL2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phf12Q5SPL2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phf12Q5SPL2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phf12Q5SPL2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phf12Q5SPL2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phf12Q5SPL2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phf12Q5SPL2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phf12Q5SPL2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phf12Q5SPL2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phf12Q5SPL2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phf12Q5SPL2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phf12Q5SPL2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf12Q5SPL2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf12Q5SPL2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf12Q5SPL2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf12Q5SPL2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf12Q5SPL2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf12Q5SPL2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf12Q5SPL2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Phf12Q5SPL2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Phf12Q5SPL2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Phf12Q5SPL2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf12Q5SPL2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf12Q5SPL2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf12Q5SPL2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf12Q5SPL2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf12Q5SPL2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Phf12Q5SPL2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Phf12Q5SPL2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Phf12Q5SPL2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phf12Q5SPL2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phf12Q5SPL2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phf12Q5SPL2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phf12Q5SPL2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf12Q5SPL2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms