Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc88aQ5SNZ0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc88aQ5SNZ0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc88aQ5SNZ0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc88aQ5SNZ0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc88aQ5SNZ0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc88aQ5SNZ0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc88aQ5SNZ0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc88aQ5SNZ0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc88aQ5SNZ0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc88aQ5SNZ0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc88aQ5SNZ0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc88aQ5SNZ0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc88aQ5SNZ0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc88aQ5SNZ0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc88aQ5SNZ0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc88aQ5SNZ0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc88aQ5SNZ0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc88aQ5SNZ0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc88aQ5SNZ0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc88aQ5SNZ0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc88aQ5SNZ0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc88aQ5SNZ0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc88aQ5SNZ0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc88aQ5SNZ0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc88aQ5SNZ0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc88aQ5SNZ0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc88aQ5SNZ0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc88aQ5SNZ0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc88aQ5SNZ0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc88aQ5SNZ0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc88aQ5SNZ0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc88aQ5SNZ0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc88aQ5SNZ0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc88aQ5SNZ0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc88aQ5SNZ0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc88aQ5SNZ0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc88aQ5SNZ0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc88aQ5SNZ0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc88aQ5SNZ0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc88aQ5SNZ0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc88aQ5SNZ0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc88aQ5SNZ0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc88aQ5SNZ0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc88aQ5SNZ0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc88aQ5SNZ0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc88aQ5SNZ0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc88aQ5SNZ0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc88aQ5SNZ0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc88aQ5SNZ0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc88aQ5SNZ0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc88aQ5SNZ0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc88aQ5SNZ0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc88aQ5SNZ0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc88aQ5SNZ0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms