Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I8

Trav3-1, T cell receptor alpha variable 3-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-1Q5R1I8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav3-1Q5R1I8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Trav3-1Q5R1I8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trav3-1Q5R1I8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav3-1Q5R1I8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms