Protein–RNA interactions for Protein: Q5QJU3

ACER2, Alkaline ceramidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER2Q5QJU3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACER2Q5QJU3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ACER2Q5QJU3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACER2Q5QJU3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACER2Q5QJU3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACER2Q5QJU3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ACER2Q5QJU3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACER2Q5QJU3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACER2Q5QJU3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ACER2Q5QJU3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACER2Q5QJU3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACER2Q5QJU3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACER2Q5QJU3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACER2Q5QJU3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ACER2Q5QJU3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ACER2Q5QJU3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ACER2Q5QJU3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACER2Q5QJU3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACER2Q5QJU3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACER2Q5QJU3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACER2Q5QJU3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ACER2Q5QJU3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACER2Q5QJU3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACER2Q5QJU3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACER2Q5QJU3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACER2Q5QJU3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACER2Q5QJU3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACER2Q5QJU3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACER2Q5QJU3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ACER2Q5QJU3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACER2Q5QJU3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACER2Q5QJU3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACER2Q5QJU3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACER2Q5QJU3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACER2Q5QJU3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACER2Q5QJU3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms