Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAPPA-AS1Q5QFB9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAPPA-AS1Q5QFB9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAPPA-AS1Q5QFB9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAPPA-AS1Q5QFB9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAPPA-AS1Q5QFB9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PAPPA-AS1Q5QFB9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PAPPA-AS1Q5QFB9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAPPA-AS1Q5QFB9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms