Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAMD4BQ5PRF9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMD4BQ5PRF9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMD4BQ5PRF9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMD4BQ5PRF9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMD4BQ5PRF9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMD4BQ5PRF9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMD4BQ5PRF9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMD4BQ5PRF9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMD4BQ5PRF9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMD4BQ5PRF9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMD4BQ5PRF9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMD4BQ5PRF9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMD4BQ5PRF9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMD4BQ5PRF9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMD4BQ5PRF9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMD4BQ5PRF9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMD4BQ5PRF9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMD4BQ5PRF9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMD4BQ5PRF9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMD4BQ5PRF9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMD4BQ5PRF9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMD4BQ5PRF9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMD4BQ5PRF9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMD4BQ5PRF9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMD4BQ5PRF9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SAMD4BQ5PRF9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMD4BQ5PRF9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms