Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rapgef6Q5NCJ1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rapgef6Q5NCJ1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Rapgef6Q5NCJ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rapgef6Q5NCJ1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rapgef6Q5NCJ1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rapgef6Q5NCJ1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rapgef6Q5NCJ1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rapgef6Q5NCJ1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rapgef6Q5NCJ1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rapgef6Q5NCJ1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rapgef6Q5NCJ1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rapgef6Q5NCJ1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rapgef6Q5NCJ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rapgef6Q5NCJ1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rapgef6Q5NCJ1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rapgef6Q5NCJ1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Rapgef6Q5NCJ1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rapgef6Q5NCJ1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rapgef6Q5NCJ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rapgef6Q5NCJ1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rapgef6Q5NCJ1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rapgef6Q5NCJ1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rapgef6Q5NCJ1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rapgef6Q5NCJ1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rapgef6Q5NCJ1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rapgef6Q5NCJ1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rapgef6Q5NCJ1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rapgef6Q5NCJ1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rapgef6Q5NCJ1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rapgef6Q5NCJ1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rapgef6Q5NCJ1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rapgef6Q5NCJ1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rapgef6Q5NCJ1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rapgef6Q5NCJ1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Rapgef6Q5NCJ1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
Rapgef6Q5NCJ1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rapgef6Q5NCJ1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rapgef6Q5NCJ1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rapgef6Q5NCJ1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rapgef6Q5NCJ1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rapgef6Q5NCJ1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rapgef6Q5NCJ1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Rapgef6Q5NCJ1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rapgef6Q5NCJ1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rapgef6Q5NCJ1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rapgef6Q5NCJ1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rapgef6Q5NCJ1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
Rapgef6Q5NCJ1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rapgef6Q5NCJ1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rapgef6Q5NCJ1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rapgef6Q5NCJ1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rapgef6Q5NCJ1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rapgef6Q5NCJ1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rapgef6Q5NCJ1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rapgef6Q5NCJ1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rapgef6Q5NCJ1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rapgef6Q5NCJ1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rapgef6Q5NCJ1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rapgef6Q5NCJ1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rapgef6Q5NCJ1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rapgef6Q5NCJ1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rapgef6Q5NCJ1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rapgef6Q5NCJ1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rapgef6Q5NCJ1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rapgef6Q5NCJ1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Rapgef6Q5NCJ1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rapgef6Q5NCJ1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Rapgef6Q5NCJ1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Rapgef6Q5NCJ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Rapgef6Q5NCJ1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rapgef6Q5NCJ1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rapgef6Q5NCJ1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rapgef6Q5NCJ1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rapgef6Q5NCJ1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Rapgef6Q5NCJ1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rapgef6Q5NCJ1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Rapgef6Q5NCJ1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rapgef6Q5NCJ1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rapgef6Q5NCJ1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Rapgef6Q5NCJ1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rapgef6Q5NCJ1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rapgef6Q5NCJ1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rapgef6Q5NCJ1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rapgef6Q5NCJ1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rapgef6Q5NCJ1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rapgef6Q5NCJ1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms