Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps41Q5KU39 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vps41Q5KU39 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps41Q5KU39 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps41Q5KU39 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps41Q5KU39 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps41Q5KU39 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps41Q5KU39 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps41Q5KU39 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps41Q5KU39 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps41Q5KU39 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps41Q5KU39 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps41Q5KU39 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps41Q5KU39 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps41Q5KU39 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps41Q5KU39 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps41Q5KU39 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps41Q5KU39 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps41Q5KU39 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps41Q5KU39 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps41Q5KU39 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps41Q5KU39 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps41Q5KU39 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps41Q5KU39 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps41Q5KU39 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps41Q5KU39 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps41Q5KU39 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps41Q5KU39 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps41Q5KU39 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Vps41Q5KU39 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps41Q5KU39 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps41Q5KU39 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps41Q5KU39 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps41Q5KU39 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps41Q5KU39 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps41Q5KU39 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps41Q5KU39 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps41Q5KU39 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps41Q5KU39 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps41Q5KU39 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps41Q5KU39 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps41Q5KU39 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps41Q5KU39 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps41Q5KU39 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps41Q5KU39 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps41Q5KU39 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps41Q5KU39 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps41Q5KU39 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps41Q5KU39 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps41Q5KU39 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps41Q5KU39 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vps41Q5KU39 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps41Q5KU39 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps41Q5KU39 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps41Q5KU39 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps41Q5KU39 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps41Q5KU39 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps41Q5KU39 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps41Q5KU39 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps41Q5KU39 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps41Q5KU39 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps41Q5KU39 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps41Q5KU39 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps41Q5KU39 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps41Q5KU39 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps41Q5KU39 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps41Q5KU39 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps41Q5KU39 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps41Q5KU39 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps41Q5KU39 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps41Q5KU39 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps41Q5KU39 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps41Q5KU39 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps41Q5KU39 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps41Q5KU39 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps41Q5KU39 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps41Q5KU39 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps41Q5KU39 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps41Q5KU39 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps41Q5KU39 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps41Q5KU39 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps41Q5KU39 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps41Q5KU39 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms