Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOHLH1Q5JUK2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOHLH1Q5JUK2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOHLH1Q5JUK2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOHLH1Q5JUK2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOHLH1Q5JUK2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOHLH1Q5JUK2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOHLH1Q5JUK2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOHLH1Q5JUK2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOHLH1Q5JUK2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOHLH1Q5JUK2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOHLH1Q5JUK2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOHLH1Q5JUK2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOHLH1Q5JUK2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOHLH1Q5JUK2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOHLH1Q5JUK2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOHLH1Q5JUK2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOHLH1Q5JUK2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOHLH1Q5JUK2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOHLH1Q5JUK2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOHLH1Q5JUK2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOHLH1Q5JUK2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOHLH1Q5JUK2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOHLH1Q5JUK2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOHLH1Q5JUK2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOHLH1Q5JUK2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOHLH1Q5JUK2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOHLH1Q5JUK2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOHLH1Q5JUK2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOHLH1Q5JUK2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms