Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C3orf38Q5JPI3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C3orf38Q5JPI3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C3orf38Q5JPI3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C3orf38Q5JPI3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C3orf38Q5JPI3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C3orf38Q5JPI3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C3orf38Q5JPI3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C3orf38Q5JPI3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C3orf38Q5JPI3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C3orf38Q5JPI3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C3orf38Q5JPI3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C3orf38Q5JPI3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
C3orf38Q5JPI3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C3orf38Q5JPI3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C3orf38Q5JPI3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C3orf38Q5JPI3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
C3orf38Q5JPI3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C3orf38Q5JPI3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C3orf38Q5JPI3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C3orf38Q5JPI3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C3orf38Q5JPI3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C3orf38Q5JPI3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C3orf38Q5JPI3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C3orf38Q5JPI3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C3orf38Q5JPI3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C3orf38Q5JPI3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C3orf38Q5JPI3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C3orf38Q5JPI3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C3orf38Q5JPI3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C3orf38Q5JPI3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C3orf38Q5JPI3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C3orf38Q5JPI3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C3orf38Q5JPI3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C3orf38Q5JPI3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C3orf38Q5JPI3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C3orf38Q5JPI3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C3orf38Q5JPI3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C3orf38Q5JPI3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C3orf38Q5JPI3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C3orf38Q5JPI3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C3orf38Q5JPI3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C3orf38Q5JPI3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C3orf38Q5JPI3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C3orf38Q5JPI3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C3orf38Q5JPI3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C3orf38Q5JPI3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C3orf38Q5JPI3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C3orf38Q5JPI3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C3orf38Q5JPI3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C3orf38Q5JPI3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C3orf38Q5JPI3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C3orf38Q5JPI3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C3orf38Q5JPI3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C3orf38Q5JPI3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C3orf38Q5JPI3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C3orf38Q5JPI3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C3orf38Q5JPI3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C3orf38Q5JPI3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C3orf38Q5JPI3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C3orf38Q5JPI3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C3orf38Q5JPI3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C3orf38Q5JPI3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C3orf38Q5JPI3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C3orf38Q5JPI3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C3orf38Q5JPI3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C3orf38Q5JPI3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C3orf38Q5JPI3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C3orf38Q5JPI3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C3orf38Q5JPI3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C3orf38Q5JPI3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C3orf38Q5JPI3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C3orf38Q5JPI3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C3orf38Q5JPI3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C3orf38Q5JPI3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C3orf38Q5JPI3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C3orf38Q5JPI3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C3orf38Q5JPI3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C3orf38Q5JPI3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C3orf38Q5JPI3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C3orf38Q5JPI3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C3orf38Q5JPI3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C3orf38Q5JPI3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
C3orf38Q5JPI3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C3orf38Q5JPI3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C3orf38Q5JPI3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C3orf38Q5JPI3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C3orf38Q5JPI3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms