Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf116Q5BN46 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf116Q5BN46 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.1 ms