Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM41BQ5BJD5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM41BQ5BJD5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM41BQ5BJD5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM41BQ5BJD5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM41BQ5BJD5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM41BQ5BJD5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM41BQ5BJD5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM41BQ5BJD5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM41BQ5BJD5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM41BQ5BJD5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM41BQ5BJD5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM41BQ5BJD5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM41BQ5BJD5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEM41BQ5BJD5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM41BQ5BJD5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM41BQ5BJD5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM41BQ5BJD5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM41BQ5BJD5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM41BQ5BJD5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM41BQ5BJD5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM41BQ5BJD5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM41BQ5BJD5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM41BQ5BJD5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM41BQ5BJD5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM41BQ5BJD5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM41BQ5BJD5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM41BQ5BJD5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM41BQ5BJD5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM41BQ5BJD5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM41BQ5BJD5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM41BQ5BJD5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.2 ms