Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAN3Q58A45 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAN3Q58A45 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAN3Q58A45 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms