Protein–RNA interactions for Protein: Q56A08

Gpkow, G-patch domain and KOW motifs-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpkowQ56A08 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GpkowQ56A08 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GpkowQ56A08 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GpkowQ56A08 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GpkowQ56A08 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GpkowQ56A08 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GpkowQ56A08 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GpkowQ56A08 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GpkowQ56A08 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GpkowQ56A08 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GpkowQ56A08 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GpkowQ56A08 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GpkowQ56A08 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GpkowQ56A08 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GpkowQ56A08 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GpkowQ56A08 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GpkowQ56A08 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GpkowQ56A08 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GpkowQ56A08 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GpkowQ56A08 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
GpkowQ56A08 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GpkowQ56A08 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GpkowQ56A08 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GpkowQ56A08 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GpkowQ56A08 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GpkowQ56A08 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GpkowQ56A08 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GpkowQ56A08 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GpkowQ56A08 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GpkowQ56A08 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GpkowQ56A08 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GpkowQ56A08 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GpkowQ56A08 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GpkowQ56A08 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GpkowQ56A08 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GpkowQ56A08 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GpkowQ56A08 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GpkowQ56A08 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GpkowQ56A08 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GpkowQ56A08 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GpkowQ56A08 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GpkowQ56A08 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GpkowQ56A08 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GpkowQ56A08 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GpkowQ56A08 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GpkowQ56A08 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GpkowQ56A08 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GpkowQ56A08 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GpkowQ56A08 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GpkowQ56A08 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GpkowQ56A08 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GpkowQ56A08 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GpkowQ56A08 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GpkowQ56A08 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GpkowQ56A08 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GpkowQ56A08 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GpkowQ56A08 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GpkowQ56A08 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GpkowQ56A08 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GpkowQ56A08 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GpkowQ56A08 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GpkowQ56A08 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GpkowQ56A08 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GpkowQ56A08 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GpkowQ56A08 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GpkowQ56A08 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GpkowQ56A08 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GpkowQ56A08 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GpkowQ56A08 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GpkowQ56A08 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GpkowQ56A08 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GpkowQ56A08 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GpkowQ56A08 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GpkowQ56A08 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GpkowQ56A08 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GpkowQ56A08 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GpkowQ56A08 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GpkowQ56A08 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GpkowQ56A08 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GpkowQ56A08 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GpkowQ56A08 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GpkowQ56A08 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GpkowQ56A08 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GpkowQ56A08 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GpkowQ56A08 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GpkowQ56A08 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GpkowQ56A08 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GpkowQ56A08 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GpkowQ56A08 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GpkowQ56A08 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GpkowQ56A08 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GpkowQ56A08 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GpkowQ56A08 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GpkowQ56A08 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GpkowQ56A08 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GpkowQ56A08 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GpkowQ56A08 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GpkowQ56A08 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
GpkowQ56A08 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GpkowQ56A08 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.8 ms