Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC93Q567U6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC93Q567U6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC93Q567U6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC93Q567U6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC93Q567U6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC93Q567U6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC93Q567U6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC93Q567U6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC93Q567U6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC93Q567U6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC93Q567U6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
CCDC93Q567U6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC93Q567U6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC93Q567U6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC93Q567U6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC93Q567U6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC93Q567U6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC93Q567U6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC93Q567U6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC93Q567U6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC93Q567U6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC93Q567U6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC93Q567U6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC93Q567U6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC93Q567U6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC93Q567U6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC93Q567U6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC93Q567U6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC93Q567U6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC93Q567U6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC93Q567U6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC93Q567U6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC93Q567U6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC93Q567U6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC93Q567U6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC93Q567U6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC93Q567U6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC93Q567U6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC93Q567U6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC93Q567U6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC93Q567U6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC93Q567U6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC93Q567U6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC93Q567U6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC93Q567U6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC93Q567U6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC93Q567U6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC93Q567U6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC93Q567U6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC93Q567U6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC93Q567U6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC93Q567U6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC93Q567U6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC93Q567U6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC93Q567U6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC93Q567U6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC93Q567U6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC93Q567U6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC93Q567U6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC93Q567U6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC93Q567U6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC93Q567U6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC93Q567U6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC93Q567U6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC93Q567U6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC93Q567U6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC93Q567U6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC93Q567U6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC93Q567U6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC93Q567U6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC93Q567U6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC93Q567U6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC93Q567U6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC93Q567U6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC93Q567U6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC93Q567U6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC93Q567U6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC93Q567U6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC93Q567U6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC93Q567U6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC93Q567U6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC93Q567U6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC93Q567U6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC93Q567U6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC93Q567U6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC93Q567U6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC93Q567U6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC93Q567U6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC93Q567U6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC93Q567U6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC93Q567U6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC93Q567U6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC93Q567U6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC93Q567U6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC93Q567U6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC93Q567U6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC93Q567U6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC93Q567U6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC93Q567U6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms