Protein–RNA interactions for Protein: Q53TQ3

INO80D, INO80 complex subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80DQ53TQ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80DQ53TQ3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80DQ53TQ3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80DQ53TQ3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80DQ53TQ3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
INO80DQ53TQ3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
INO80DQ53TQ3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
INO80DQ53TQ3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
INO80DQ53TQ3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
INO80DQ53TQ3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80DQ53TQ3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80DQ53TQ3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80DQ53TQ3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80DQ53TQ3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80DQ53TQ3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80DQ53TQ3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
INO80DQ53TQ3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
INO80DQ53TQ3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
INO80DQ53TQ3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
INO80DQ53TQ3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
INO80DQ53TQ3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
INO80DQ53TQ3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
INO80DQ53TQ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
INO80DQ53TQ3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
INO80DQ53TQ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
INO80DQ53TQ3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
INO80DQ53TQ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80DQ53TQ3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80DQ53TQ3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
INO80DQ53TQ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
INO80DQ53TQ3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
INO80DQ53TQ3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80DQ53TQ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80DQ53TQ3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80DQ53TQ3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80DQ53TQ3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
INO80DQ53TQ3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
INO80DQ53TQ3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
INO80DQ53TQ3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
INO80DQ53TQ3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
INO80DQ53TQ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
INO80DQ53TQ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
INO80DQ53TQ3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
INO80DQ53TQ3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
INO80DQ53TQ3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
INO80DQ53TQ3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms