Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSM3Q53FZ2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACSM3Q53FZ2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACSM3Q53FZ2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM3Q53FZ2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM3Q53FZ2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACSM3Q53FZ2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM3Q53FZ2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM3Q53FZ2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM3Q53FZ2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM3Q53FZ2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSM3Q53FZ2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSM3Q53FZ2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSM3Q53FZ2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSM3Q53FZ2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSM3Q53FZ2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSM3Q53FZ2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSM3Q53FZ2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSM3Q53FZ2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSM3Q53FZ2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSM3Q53FZ2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSM3Q53FZ2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSM3Q53FZ2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSM3Q53FZ2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSM3Q53FZ2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSM3Q53FZ2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms