Protein–RNA interactions for Protein: Q53ET0

CRTC2, CREB-regulated transcription coactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTC2Q53ET0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRTC2Q53ET0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRTC2Q53ET0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRTC2Q53ET0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRTC2Q53ET0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRTC2Q53ET0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRTC2Q53ET0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRTC2Q53ET0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRTC2Q53ET0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRTC2Q53ET0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRTC2Q53ET0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRTC2Q53ET0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRTC2Q53ET0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRTC2Q53ET0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRTC2Q53ET0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRTC2Q53ET0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRTC2Q53ET0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRTC2Q53ET0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRTC2Q53ET0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTC2Q53ET0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTC2Q53ET0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTC2Q53ET0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTC2Q53ET0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTC2Q53ET0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTC2Q53ET0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRTC2Q53ET0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRTC2Q53ET0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRTC2Q53ET0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRTC2Q53ET0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTC2Q53ET0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTC2Q53ET0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTC2Q53ET0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTC2Q53ET0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRTC2Q53ET0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRTC2Q53ET0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRTC2Q53ET0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRTC2Q53ET0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CRTC2Q53ET0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CRTC2Q53ET0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRTC2Q53ET0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRTC2Q53ET0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRTC2Q53ET0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRTC2Q53ET0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRTC2Q53ET0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRTC2Q53ET0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRTC2Q53ET0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRTC2Q53ET0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRTC2Q53ET0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRTC2Q53ET0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRTC2Q53ET0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CRTC2Q53ET0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRTC2Q53ET0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRTC2Q53ET0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRTC2Q53ET0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRTC2Q53ET0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRTC2Q53ET0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CRTC2Q53ET0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRTC2Q53ET0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRTC2Q53ET0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRTC2Q53ET0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRTC2Q53ET0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRTC2Q53ET0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRTC2Q53ET0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRTC2Q53ET0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRTC2Q53ET0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRTC2Q53ET0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRTC2Q53ET0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRTC2Q53ET0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRTC2Q53ET0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CRTC2Q53ET0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRTC2Q53ET0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRTC2Q53ET0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRTC2Q53ET0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CRTC2Q53ET0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRTC2Q53ET0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms