Protein–RNA interactions for Protein: Q53EL6

PDCD4, Programmed cell death protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4Q53EL6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCD4Q53EL6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCD4Q53EL6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCD4Q53EL6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCD4Q53EL6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCD4Q53EL6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCD4Q53EL6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCD4Q53EL6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCD4Q53EL6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCD4Q53EL6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCD4Q53EL6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCD4Q53EL6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCD4Q53EL6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCD4Q53EL6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCD4Q53EL6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCD4Q53EL6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCD4Q53EL6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCD4Q53EL6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCD4Q53EL6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCD4Q53EL6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCD4Q53EL6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCD4Q53EL6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCD4Q53EL6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCD4Q53EL6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCD4Q53EL6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCD4Q53EL6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCD4Q53EL6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCD4Q53EL6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCD4Q53EL6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCD4Q53EL6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCD4Q53EL6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDCD4Q53EL6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCD4Q53EL6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCD4Q53EL6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCD4Q53EL6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCD4Q53EL6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCD4Q53EL6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCD4Q53EL6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCD4Q53EL6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCD4Q53EL6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCD4Q53EL6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCD4Q53EL6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCD4Q53EL6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCD4Q53EL6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms