Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGAP29Q52LW3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGAP29Q52LW3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGAP29Q52LW3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGAP29Q52LW3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGAP29Q52LW3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGAP29Q52LW3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGAP29Q52LW3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGAP29Q52LW3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGAP29Q52LW3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGAP29Q52LW3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGAP29Q52LW3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGAP29Q52LW3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGAP29Q52LW3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGAP29Q52LW3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGAP29Q52LW3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGAP29Q52LW3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGAP29Q52LW3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
ARHGAP29Q52LW3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGAP29Q52LW3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGAP29Q52LW3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGAP29Q52LW3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGAP29Q52LW3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGAP29Q52LW3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGAP29Q52LW3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGAP29Q52LW3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGAP29Q52LW3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGAP29Q52LW3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGAP29Q52LW3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGAP29Q52LW3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGAP29Q52LW3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGAP29Q52LW3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGAP29Q52LW3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGAP29Q52LW3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGAP29Q52LW3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGAP29Q52LW3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGAP29Q52LW3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGAP29Q52LW3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGAP29Q52LW3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGAP29Q52LW3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARHGAP29Q52LW3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGAP29Q52LW3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGAP29Q52LW3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGAP29Q52LW3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGAP29Q52LW3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGAP29Q52LW3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGAP29Q52LW3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGAP29Q52LW3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGAP29Q52LW3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGAP29Q52LW3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGAP29Q52LW3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGAP29Q52LW3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGAP29Q52LW3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGAP29Q52LW3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGAP29Q52LW3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGAP29Q52LW3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGAP29Q52LW3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGAP29Q52LW3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGAP29Q52LW3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGAP29Q52LW3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGAP29Q52LW3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGAP29Q52LW3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGAP29Q52LW3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGAP29Q52LW3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGAP29Q52LW3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGAP29Q52LW3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP29Q52LW3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP29Q52LW3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP29Q52LW3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP29Q52LW3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP29Q52LW3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP29Q52LW3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms