Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prune2Q52KR3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prune2Q52KR3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prune2Q52KR3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prune2Q52KR3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prune2Q52KR3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prune2Q52KR3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prune2Q52KR3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prune2Q52KR3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prune2Q52KR3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prune2Q52KR3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prune2Q52KR3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prune2Q52KR3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prune2Q52KR3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prune2Q52KR3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prune2Q52KR3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prune2Q52KR3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prune2Q52KR3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prune2Q52KR3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Prune2Q52KR3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prune2Q52KR3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prune2Q52KR3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prune2Q52KR3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prune2Q52KR3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prune2Q52KR3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prune2Q52KR3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prune2Q52KR3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prune2Q52KR3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prune2Q52KR3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prune2Q52KR3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prune2Q52KR3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prune2Q52KR3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prune2Q52KR3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Prune2Q52KR3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prune2Q52KR3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prune2Q52KR3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prune2Q52KR3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prune2Q52KR3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prune2Q52KR3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prune2Q52KR3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prune2Q52KR3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prune2Q52KR3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prune2Q52KR3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prune2Q52KR3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prune2Q52KR3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prune2Q52KR3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prune2Q52KR3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prune2Q52KR3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prune2Q52KR3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prune2Q52KR3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prune2Q52KR3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prune2Q52KR3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prune2Q52KR3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prune2Q52KR3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prune2Q52KR3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prune2Q52KR3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prune2Q52KR3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prune2Q52KR3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prune2Q52KR3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prune2Q52KR3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prune2Q52KR3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prune2Q52KR3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prune2Q52KR3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prune2Q52KR3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prune2Q52KR3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prune2Q52KR3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prune2Q52KR3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prune2Q52KR3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prune2Q52KR3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prune2Q52KR3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prune2Q52KR3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prune2Q52KR3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prune2Q52KR3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prune2Q52KR3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prune2Q52KR3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prune2Q52KR3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prune2Q52KR3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prune2Q52KR3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prune2Q52KR3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prune2Q52KR3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prune2Q52KR3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prune2Q52KR3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prune2Q52KR3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prune2Q52KR3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prune2Q52KR3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prune2Q52KR3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prune2Q52KR3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prune2Q52KR3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms