Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Prpf38aQ4FK66 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Prpf38aQ4FK66 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prpf38aQ4FK66 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prpf38aQ4FK66 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prpf38aQ4FK66 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Prpf38aQ4FK66 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prpf38aQ4FK66 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prpf38aQ4FK66 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prpf38aQ4FK66 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prpf38aQ4FK66 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prpf38aQ4FK66 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prpf38aQ4FK66 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prpf38aQ4FK66 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Prpf38aQ4FK66 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prpf38aQ4FK66 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prpf38aQ4FK66 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prpf38aQ4FK66 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prpf38aQ4FK66 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prpf38aQ4FK66 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prpf38aQ4FK66 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Prpf38aQ4FK66 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prpf38aQ4FK66 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prpf38aQ4FK66 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prpf38aQ4FK66 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prpf38aQ4FK66 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Prpf38aQ4FK66 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prpf38aQ4FK66 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prpf38aQ4FK66 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prpf38aQ4FK66 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prpf38aQ4FK66 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prpf38aQ4FK66 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prpf38aQ4FK66 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prpf38aQ4FK66 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prpf38aQ4FK66 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prpf38aQ4FK66 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Prpf38aQ4FK66 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Prpf38aQ4FK66 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prpf38aQ4FK66 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Prpf38aQ4FK66 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Prpf38aQ4FK66 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prpf38aQ4FK66 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prpf38aQ4FK66 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prpf38aQ4FK66 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Prpf38aQ4FK66 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prpf38aQ4FK66 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prpf38aQ4FK66 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Prpf38aQ4FK66 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prpf38aQ4FK66 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prpf38aQ4FK66 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prpf38aQ4FK66 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prpf38aQ4FK66 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prpf38aQ4FK66 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prpf38aQ4FK66 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prpf38aQ4FK66 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prpf38aQ4FK66 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prpf38aQ4FK66 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prpf38aQ4FK66 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prpf38aQ4FK66 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prpf38aQ4FK66 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prpf38aQ4FK66 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prpf38aQ4FK66 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prpf38aQ4FK66 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prpf38aQ4FK66 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prpf38aQ4FK66 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prpf38aQ4FK66 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prpf38aQ4FK66 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prpf38aQ4FK66 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prpf38aQ4FK66 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prpf38aQ4FK66 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prpf38aQ4FK66 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Prpf38aQ4FK66 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prpf38aQ4FK66 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prpf38aQ4FK66 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prpf38aQ4FK66 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prpf38aQ4FK66 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prpf38aQ4FK66 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prpf38aQ4FK66 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prpf38aQ4FK66 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prpf38aQ4FK66 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prpf38aQ4FK66 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prpf38aQ4FK66 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prpf38aQ4FK66 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prpf38aQ4FK66 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prpf38aQ4FK66 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prpf38aQ4FK66 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prpf38aQ4FK66 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prpf38aQ4FK66 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prpf38aQ4FK66 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prpf38aQ4FK66 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prpf38aQ4FK66 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prpf38aQ4FK66 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Prpf38aQ4FK66 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prpf38aQ4FK66 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prpf38aQ4FK66 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prpf38aQ4FK66 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms