Protein–RNA interactions for Protein: Q497V5

Srbd1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srbd1Q497V5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srbd1Q497V5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srbd1Q497V5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srbd1Q497V5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Srbd1Q497V5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srbd1Q497V5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Srbd1Q497V5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Srbd1Q497V5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srbd1Q497V5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srbd1Q497V5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srbd1Q497V5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srbd1Q497V5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srbd1Q497V5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Srbd1Q497V5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srbd1Q497V5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srbd1Q497V5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srbd1Q497V5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srbd1Q497V5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srbd1Q497V5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srbd1Q497V5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srbd1Q497V5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srbd1Q497V5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srbd1Q497V5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srbd1Q497V5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srbd1Q497V5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srbd1Q497V5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srbd1Q497V5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srbd1Q497V5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Srbd1Q497V5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srbd1Q497V5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srbd1Q497V5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Srbd1Q497V5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Srbd1Q497V5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Srbd1Q497V5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Srbd1Q497V5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Srbd1Q497V5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Srbd1Q497V5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Srbd1Q497V5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Srbd1Q497V5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Srbd1Q497V5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srbd1Q497V5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srbd1Q497V5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srbd1Q497V5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srbd1Q497V5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srbd1Q497V5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srbd1Q497V5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srbd1Q497V5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Srbd1Q497V5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srbd1Q497V5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srbd1Q497V5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srbd1Q497V5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srbd1Q497V5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srbd1Q497V5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srbd1Q497V5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srbd1Q497V5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srbd1Q497V5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srbd1Q497V5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms