Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC36A3Q495N2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC36A3Q495N2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC36A3Q495N2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC36A3Q495N2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC36A3Q495N2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC36A3Q495N2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC36A3Q495N2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC36A3Q495N2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC36A3Q495N2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC36A3Q495N2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC36A3Q495N2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC36A3Q495N2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC36A3Q495N2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC36A3Q495N2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC36A3Q495N2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC36A3Q495N2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC36A3Q495N2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC36A3Q495N2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC36A3Q495N2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC36A3Q495N2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC36A3Q495N2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC36A3Q495N2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC36A3Q495N2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC36A3Q495N2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC36A3Q495N2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC36A3Q495N2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC36A3Q495N2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC36A3Q495N2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC36A3Q495N2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC36A3Q495N2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC36A3Q495N2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC36A3Q495N2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC36A3Q495N2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC36A3Q495N2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC36A3Q495N2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC36A3Q495N2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms