Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Afg1lQ3V384 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Afg1lQ3V384 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Afg1lQ3V384 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Afg1lQ3V384 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Afg1lQ3V384 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Afg1lQ3V384 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Afg1lQ3V384 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Afg1lQ3V384 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Afg1lQ3V384 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Afg1lQ3V384 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Afg1lQ3V384 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Afg1lQ3V384 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Afg1lQ3V384 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Afg1lQ3V384 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Afg1lQ3V384 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Afg1lQ3V384 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Afg1lQ3V384 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Afg1lQ3V384 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Afg1lQ3V384 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Afg1lQ3V384 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Afg1lQ3V384 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Afg1lQ3V384 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Afg1lQ3V384 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Afg1lQ3V384 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Afg1lQ3V384 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Afg1lQ3V384 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Afg1lQ3V384 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Afg1lQ3V384 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg1lQ3V384 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg1lQ3V384 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg1lQ3V384 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Afg1lQ3V384 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Afg1lQ3V384 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Afg1lQ3V384 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Afg1lQ3V384 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Afg1lQ3V384 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Afg1lQ3V384 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Afg1lQ3V384 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Afg1lQ3V384 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Afg1lQ3V384 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Afg1lQ3V384 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Afg1lQ3V384 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Afg1lQ3V384 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Afg1lQ3V384 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Afg1lQ3V384 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Afg1lQ3V384 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms