Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ulk4Q3V129 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ulk4Q3V129 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ulk4Q3V129 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ulk4Q3V129 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ulk4Q3V129 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ulk4Q3V129 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ulk4Q3V129 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ulk4Q3V129 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ulk4Q3V129 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ulk4Q3V129 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ulk4Q3V129 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ulk4Q3V129 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ulk4Q3V129 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ulk4Q3V129 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ulk4Q3V129 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ulk4Q3V129 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ulk4Q3V129 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ulk4Q3V129 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ulk4Q3V129 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ulk4Q3V129 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ulk4Q3V129 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ulk4Q3V129 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ulk4Q3V129 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ulk4Q3V129 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ulk4Q3V129 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ulk4Q3V129 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ulk4Q3V129 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ulk4Q3V129 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ulk4Q3V129 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ulk4Q3V129 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ulk4Q3V129 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ulk4Q3V129 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ulk4Q3V129 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ulk4Q3V129 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ulk4Q3V129 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ulk4Q3V129 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ulk4Q3V129 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ulk4Q3V129 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ulk4Q3V129 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ulk4Q3V129 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ulk4Q3V129 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ulk4Q3V129 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ulk4Q3V129 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ulk4Q3V129 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ulk4Q3V129 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ulk4Q3V129 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ulk4Q3V129 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ulk4Q3V129 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ulk4Q3V129 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ulk4Q3V129 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ulk4Q3V129 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ulk4Q3V129 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ulk4Q3V129 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ulk4Q3V129 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ulk4Q3V129 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ulk4Q3V129 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ulk4Q3V129 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ulk4Q3V129 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ulk4Q3V129 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ulk4Q3V129 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ulk4Q3V129 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ulk4Q3V129 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ulk4Q3V129 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ulk4Q3V129 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ulk4Q3V129 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ulk4Q3V129 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ulk4Q3V129 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ulk4Q3V129 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ulk4Q3V129 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ulk4Q3V129 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ulk4Q3V129 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ulk4Q3V129 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ulk4Q3V129 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ulk4Q3V129 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ulk4Q3V129 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ulk4Q3V129 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ulk4Q3V129 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ulk4Q3V129 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ulk4Q3V129 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ulk4Q3V129 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ulk4Q3V129 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ulk4Q3V129 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ulk4Q3V129 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ulk4Q3V129 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ulk4Q3V129 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ulk4Q3V129 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ulk4Q3V129 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ulk4Q3V129 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ulk4Q3V129 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ulk4Q3V129 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ulk4Q3V129 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ulk4Q3V129 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ulk4Q3V129 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ulk4Q3V129 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ulk4Q3V129 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ulk4Q3V129 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ulk4Q3V129 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ulk4Q3V129 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ulk4Q3V129 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms