Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Usp48Q3V0C5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Usp48Q3V0C5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Usp48Q3V0C5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp48Q3V0C5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp48Q3V0C5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp48Q3V0C5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp48Q3V0C5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp48Q3V0C5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp48Q3V0C5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp48Q3V0C5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp48Q3V0C5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp48Q3V0C5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp48Q3V0C5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp48Q3V0C5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp48Q3V0C5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Usp48Q3V0C5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp48Q3V0C5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp48Q3V0C5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp48Q3V0C5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp48Q3V0C5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp48Q3V0C5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp48Q3V0C5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Usp48Q3V0C5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp48Q3V0C5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp48Q3V0C5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp48Q3V0C5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp48Q3V0C5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp48Q3V0C5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp48Q3V0C5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp48Q3V0C5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp48Q3V0C5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp48Q3V0C5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp48Q3V0C5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp48Q3V0C5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Usp48Q3V0C5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Usp48Q3V0C5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Usp48Q3V0C5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Usp48Q3V0C5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp48Q3V0C5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp48Q3V0C5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Usp48Q3V0C5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Usp48Q3V0C5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Usp48Q3V0C5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp48Q3V0C5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp48Q3V0C5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp48Q3V0C5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp48Q3V0C5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp48Q3V0C5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp48Q3V0C5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp48Q3V0C5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp48Q3V0C5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp48Q3V0C5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp48Q3V0C5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp48Q3V0C5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp48Q3V0C5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Usp48Q3V0C5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp48Q3V0C5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp48Q3V0C5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp48Q3V0C5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp48Q3V0C5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp48Q3V0C5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp48Q3V0C5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp48Q3V0C5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp48Q3V0C5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp48Q3V0C5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp48Q3V0C5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp48Q3V0C5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp48Q3V0C5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp48Q3V0C5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp48Q3V0C5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp48Q3V0C5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp48Q3V0C5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp48Q3V0C5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp48Q3V0C5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp48Q3V0C5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp48Q3V0C5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp48Q3V0C5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp48Q3V0C5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp48Q3V0C5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp48Q3V0C5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp48Q3V0C5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp48Q3V0C5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp48Q3V0C5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp48Q3V0C5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp48Q3V0C5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp48Q3V0C5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Usp48Q3V0C5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Usp48Q3V0C5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Usp48Q3V0C5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp48Q3V0C5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp48Q3V0C5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp48Q3V0C5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp48Q3V0C5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp48Q3V0C5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp48Q3V0C5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp48Q3V0C5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp48Q3V0C5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp48Q3V0C5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp48Q3V0C5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms