Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm6Q3UZD5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm6Q3UZD5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm6Q3UZD5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm6Q3UZD5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm6Q3UZD5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm6Q3UZD5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm6Q3UZD5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm6Q3UZD5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm6Q3UZD5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm6Q3UZD5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm6Q3UZD5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm6Q3UZD5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm6Q3UZD5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm6Q3UZD5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm6Q3UZD5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm6Q3UZD5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm6Q3UZD5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm6Q3UZD5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm6Q3UZD5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm6Q3UZD5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm6Q3UZD5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm6Q3UZD5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm6Q3UZD5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm6Q3UZD5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm6Q3UZD5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm6Q3UZD5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm6Q3UZD5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm6Q3UZD5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm6Q3UZD5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm6Q3UZD5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm6Q3UZD5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm6Q3UZD5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm6Q3UZD5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm6Q3UZD5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm6Q3UZD5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm6Q3UZD5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm6Q3UZD5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm6Q3UZD5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm6Q3UZD5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm6Q3UZD5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm6Q3UZD5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm6Q3UZD5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm6Q3UZD5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm6Q3UZD5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm6Q3UZD5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm6Q3UZD5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm6Q3UZD5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm6Q3UZD5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm6Q3UZD5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm6Q3UZD5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm6Q3UZD5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm6Q3UZD5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm6Q3UZD5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm6Q3UZD5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm6Q3UZD5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm6Q3UZD5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm6Q3UZD5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm6Q3UZD5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm6Q3UZD5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prdm6Q3UZD5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm6Q3UZD5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm6Q3UZD5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 204 ms