Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5aQ3UXZ9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5aQ3UXZ9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Kdm5aQ3UXZ9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Kdm5aQ3UXZ9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Kdm5aQ3UXZ9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Kdm5aQ3UXZ9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Kdm5aQ3UXZ9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Kdm5aQ3UXZ9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Kdm5aQ3UXZ9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Kdm5aQ3UXZ9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Kdm5aQ3UXZ9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Kdm5aQ3UXZ9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Kdm5aQ3UXZ9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Kdm5aQ3UXZ9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Kdm5aQ3UXZ9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Kdm5aQ3UXZ9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Kdm5aQ3UXZ9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Kdm5aQ3UXZ9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Kdm5aQ3UXZ9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Kdm5aQ3UXZ9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Kdm5aQ3UXZ9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Kdm5aQ3UXZ9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Kdm5aQ3UXZ9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.97
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm5aQ3UXZ9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm5aQ3UXZ9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Kdm5aQ3UXZ9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Kdm5aQ3UXZ9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Kdm5aQ3UXZ9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Kdm5aQ3UXZ9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Kdm5aQ3UXZ9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Kdm5aQ3UXZ9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Kdm5aQ3UXZ9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm5aQ3UXZ9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm5aQ3UXZ9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Kdm5aQ3UXZ9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5aQ3UXZ9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5aQ3UXZ9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5aQ3UXZ9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Kdm5aQ3UXZ9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Kdm5aQ3UXZ9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Kdm5aQ3UXZ9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Kdm5aQ3UXZ9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Kdm5aQ3UXZ9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Kdm5aQ3UXZ9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Kdm5aQ3UXZ9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Kdm5aQ3UXZ9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Kdm5aQ3UXZ9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Kdm5aQ3UXZ9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kdm5aQ3UXZ9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kdm5aQ3UXZ9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kdm5aQ3UXZ9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kdm5aQ3UXZ9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kdm5aQ3UXZ9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm5aQ3UXZ9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm5aQ3UXZ9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Kdm5aQ3UXZ9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Kdm5aQ3UXZ9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Kdm5aQ3UXZ9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Kdm5aQ3UXZ9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Kdm5aQ3UXZ9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Kdm5aQ3UXZ9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm5aQ3UXZ9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm5aQ3UXZ9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm5aQ3UXZ9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Kdm5aQ3UXZ9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Kdm5aQ3UXZ9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5aQ3UXZ9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5aQ3UXZ9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5aQ3UXZ9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5aQ3UXZ9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Kdm5aQ3UXZ9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm5aQ3UXZ9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Kdm5aQ3UXZ9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Kdm5aQ3UXZ9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Kdm5aQ3UXZ9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Kdm5aQ3UXZ9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Kdm5aQ3UXZ9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm5aQ3UXZ9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235.5 ms