Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3l2Q3UXB0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3l2Q3UXB0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3l2Q3UXB0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3l2Q3UXB0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3l2Q3UXB0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3l2Q3UXB0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3l2Q3UXB0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3l2Q3UXB0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3l2Q3UXB0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3l2Q3UXB0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3l2Q3UXB0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3l2Q3UXB0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3l2Q3UXB0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3l2Q3UXB0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd3l2Q3UXB0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd3l2Q3UXB0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd3l2Q3UXB0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd3l2Q3UXB0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd3l2Q3UXB0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd3l2Q3UXB0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd3l2Q3UXB0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms