Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clpsl2Q3UW21 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Clpsl2Q3UW21 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clpsl2Q3UW21 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clpsl2Q3UW21 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clpsl2Q3UW21 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clpsl2Q3UW21 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clpsl2Q3UW21 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clpsl2Q3UW21 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clpsl2Q3UW21 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clpsl2Q3UW21 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clpsl2Q3UW21 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clpsl2Q3UW21 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clpsl2Q3UW21 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clpsl2Q3UW21 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clpsl2Q3UW21 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clpsl2Q3UW21 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clpsl2Q3UW21 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clpsl2Q3UW21 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clpsl2Q3UW21 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clpsl2Q3UW21 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clpsl2Q3UW21 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clpsl2Q3UW21 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clpsl2Q3UW21 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clpsl2Q3UW21 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clpsl2Q3UW21 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clpsl2Q3UW21 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clpsl2Q3UW21 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clpsl2Q3UW21 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clpsl2Q3UW21 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clpsl2Q3UW21 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Clpsl2Q3UW21 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clpsl2Q3UW21 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clpsl2Q3UW21 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Clpsl2Q3UW21 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clpsl2Q3UW21 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clpsl2Q3UW21 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clpsl2Q3UW21 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clpsl2Q3UW21 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clpsl2Q3UW21 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clpsl2Q3UW21 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Clpsl2Q3UW21 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clpsl2Q3UW21 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clpsl2Q3UW21 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clpsl2Q3UW21 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clpsl2Q3UW21 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clpsl2Q3UW21 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clpsl2Q3UW21 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clpsl2Q3UW21 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clpsl2Q3UW21 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clpsl2Q3UW21 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clpsl2Q3UW21 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clpsl2Q3UW21 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clpsl2Q3UW21 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clpsl2Q3UW21 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clpsl2Q3UW21 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clpsl2Q3UW21 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clpsl2Q3UW21 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clpsl2Q3UW21 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clpsl2Q3UW21 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clpsl2Q3UW21 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clpsl2Q3UW21 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clpsl2Q3UW21 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clpsl2Q3UW21 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clpsl2Q3UW21 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clpsl2Q3UW21 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clpsl2Q3UW21 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Clpsl2Q3UW21 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clpsl2Q3UW21 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clpsl2Q3UW21 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clpsl2Q3UW21 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clpsl2Q3UW21 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clpsl2Q3UW21 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clpsl2Q3UW21 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clpsl2Q3UW21 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms