Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-Eb2Q3UUV9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-Eb2Q3UUV9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-Eb2Q3UUV9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-Eb2Q3UUV9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22■■□□□ 1.11
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-Eb2Q3UUV9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
H2-Eb2Q3UUV9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Eb2Q3UUV9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Eb2Q3UUV9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Eb2Q3UUV9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Eb2Q3UUV9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Eb2Q3UUV9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Eb2Q3UUV9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-Eb2Q3UUV9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-Eb2Q3UUV9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-Eb2Q3UUV9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-Eb2Q3UUV9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-Eb2Q3UUV9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-Eb2Q3UUV9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-Eb2Q3UUV9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-Eb2Q3UUV9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-Eb2Q3UUV9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-Eb2Q3UUV9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-Eb2Q3UUV9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-Eb2Q3UUV9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-Eb2Q3UUV9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-Eb2Q3UUV9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-Eb2Q3UUV9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-Eb2Q3UUV9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-Eb2Q3UUV9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-Eb2Q3UUV9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-Eb2Q3UUV9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-Eb2Q3UUV9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-Eb2Q3UUV9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-Eb2Q3UUV9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-Eb2Q3UUV9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2-Eb2Q3UUV9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2-Eb2Q3UUV9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2-Eb2Q3UUV9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2-Eb2Q3UUV9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-Eb2Q3UUV9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-Eb2Q3UUV9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-Eb2Q3UUV9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Eb2Q3UUV9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Eb2Q3UUV9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Eb2Q3UUV9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-Eb2Q3UUV9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-Eb2Q3UUV9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-Eb2Q3UUV9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-Eb2Q3UUV9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-Eb2Q3UUV9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-Eb2Q3UUV9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-Eb2Q3UUV9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-Eb2Q3UUV9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-Eb2Q3UUV9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-Eb2Q3UUV9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-Eb2Q3UUV9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-Eb2Q3UUV9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-Eb2Q3UUV9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Eb2Q3UUV9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Eb2Q3UUV9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Eb2Q3UUV9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Eb2Q3UUV9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms