Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm29609Q3UU56 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm29609Q3UU56 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm29609Q3UU56 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm29609Q3UU56 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm29609Q3UU56 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm29609Q3UU56 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm29609Q3UU56 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm29609Q3UU56 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm29609Q3UU56 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm29609Q3UU56 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm29609Q3UU56 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm29609Q3UU56 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm29609Q3UU56 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm29609Q3UU56 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm29609Q3UU56 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm29609Q3UU56 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm29609Q3UU56 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm29609Q3UU56 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm29609Q3UU56 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm29609Q3UU56 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm29609Q3UU56 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm29609Q3UU56 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm29609Q3UU56 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm29609Q3UU56 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm29609Q3UU56 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm29609Q3UU56 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm29609Q3UU56 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm29609Q3UU56 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm29609Q3UU56 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm29609Q3UU56 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm29609Q3UU56 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm29609Q3UU56 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm29609Q3UU56 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm29609Q3UU56 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm29609Q3UU56 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm29609Q3UU56 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm29609Q3UU56 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm29609Q3UU56 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm29609Q3UU56 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm29609Q3UU56 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm29609Q3UU56 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
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