Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ2

Ubtfl1, Upstream-binding factor 1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtfl1Q3USZ2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubtfl1Q3USZ2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubtfl1Q3USZ2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubtfl1Q3USZ2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubtfl1Q3USZ2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubtfl1Q3USZ2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubtfl1Q3USZ2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubtfl1Q3USZ2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubtfl1Q3USZ2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubtfl1Q3USZ2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubtfl1Q3USZ2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubtfl1Q3USZ2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubtfl1Q3USZ2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubtfl1Q3USZ2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubtfl1Q3USZ2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubtfl1Q3USZ2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubtfl1Q3USZ2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubtfl1Q3USZ2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubtfl1Q3USZ2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubtfl1Q3USZ2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubtfl1Q3USZ2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubtfl1Q3USZ2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubtfl1Q3USZ2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubtfl1Q3USZ2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubtfl1Q3USZ2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubtfl1Q3USZ2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubtfl1Q3USZ2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubtfl1Q3USZ2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubtfl1Q3USZ2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubtfl1Q3USZ2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubtfl1Q3USZ2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubtfl1Q3USZ2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubtfl1Q3USZ2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubtfl1Q3USZ2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubtfl1Q3USZ2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubtfl1Q3USZ2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubtfl1Q3USZ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubtfl1Q3USZ2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubtfl1Q3USZ2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubtfl1Q3USZ2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubtfl1Q3USZ2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubtfl1Q3USZ2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubtfl1Q3USZ2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubtfl1Q3USZ2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubtfl1Q3USZ2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubtfl1Q3USZ2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubtfl1Q3USZ2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubtfl1Q3USZ2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubtfl1Q3USZ2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubtfl1Q3USZ2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubtfl1Q3USZ2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubtfl1Q3USZ2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubtfl1Q3USZ2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubtfl1Q3USZ2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubtfl1Q3USZ2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubtfl1Q3USZ2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubtfl1Q3USZ2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubtfl1Q3USZ2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubtfl1Q3USZ2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubtfl1Q3USZ2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ubtfl1Q3USZ2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ubtfl1Q3USZ2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ubtfl1Q3USZ2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubtfl1Q3USZ2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubtfl1Q3USZ2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubtfl1Q3USZ2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubtfl1Q3USZ2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubtfl1Q3USZ2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubtfl1Q3USZ2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubtfl1Q3USZ2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubtfl1Q3USZ2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubtfl1Q3USZ2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubtfl1Q3USZ2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubtfl1Q3USZ2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubtfl1Q3USZ2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubtfl1Q3USZ2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubtfl1Q3USZ2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubtfl1Q3USZ2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubtfl1Q3USZ2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubtfl1Q3USZ2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubtfl1Q3USZ2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubtfl1Q3USZ2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubtfl1Q3USZ2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubtfl1Q3USZ2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ubtfl1Q3USZ2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubtfl1Q3USZ2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubtfl1Q3USZ2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubtfl1Q3USZ2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubtfl1Q3USZ2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubtfl1Q3USZ2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubtfl1Q3USZ2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubtfl1Q3USZ2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubtfl1Q3USZ2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubtfl1Q3USZ2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubtfl1Q3USZ2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubtfl1Q3USZ2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubtfl1Q3USZ2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubtfl1Q3USZ2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubtfl1Q3USZ2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubtfl1Q3USZ2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms