Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fchsd2Q3USJ8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fchsd2Q3USJ8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fchsd2Q3USJ8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Fchsd2Q3USJ8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Fchsd2Q3USJ8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fchsd2Q3USJ8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fchsd2Q3USJ8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Fchsd2Q3USJ8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Fchsd2Q3USJ8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fchsd2Q3USJ8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fchsd2Q3USJ8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fchsd2Q3USJ8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fchsd2Q3USJ8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fchsd2Q3USJ8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fchsd2Q3USJ8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Fchsd2Q3USJ8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fchsd2Q3USJ8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fchsd2Q3USJ8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fchsd2Q3USJ8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fchsd2Q3USJ8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Fchsd2Q3USJ8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Fchsd2Q3USJ8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fchsd2Q3USJ8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Fchsd2Q3USJ8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Fchsd2Q3USJ8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Fchsd2Q3USJ8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Fchsd2Q3USJ8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Fchsd2Q3USJ8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Fchsd2Q3USJ8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Fchsd2Q3USJ8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Fchsd2Q3USJ8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Fchsd2Q3USJ8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Fchsd2Q3USJ8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Fchsd2Q3USJ8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Fchsd2Q3USJ8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Fchsd2Q3USJ8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Fchsd2Q3USJ8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Fchsd2Q3USJ8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Fchsd2Q3USJ8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Fchsd2Q3USJ8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fchsd2Q3USJ8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fchsd2Q3USJ8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Fchsd2Q3USJ8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Fchsd2Q3USJ8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Fchsd2Q3USJ8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Fchsd2Q3USJ8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Fchsd2Q3USJ8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Fchsd2Q3USJ8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Fchsd2Q3USJ8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Fchsd2Q3USJ8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Fchsd2Q3USJ8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Fchsd2Q3USJ8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Fchsd2Q3USJ8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Fchsd2Q3USJ8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Fchsd2Q3USJ8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Fchsd2Q3USJ8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Fchsd2Q3USJ8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Fchsd2Q3USJ8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Fchsd2Q3USJ8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Fchsd2Q3USJ8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Fchsd2Q3USJ8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Fchsd2Q3USJ8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Fchsd2Q3USJ8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Fchsd2Q3USJ8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Fchsd2Q3USJ8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Fchsd2Q3USJ8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Fchsd2Q3USJ8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Fchsd2Q3USJ8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Fchsd2Q3USJ8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Fchsd2Q3USJ8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Fchsd2Q3USJ8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Fchsd2Q3USJ8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Fchsd2Q3USJ8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Fchsd2Q3USJ8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Fchsd2Q3USJ8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Fchsd2Q3USJ8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fchsd2Q3USJ8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fchsd2Q3USJ8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fchsd2Q3USJ8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fchsd2Q3USJ8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Fchsd2Q3USJ8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Fchsd2Q3USJ8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Fchsd2Q3USJ8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Fchsd2Q3USJ8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Fchsd2Q3USJ8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Fchsd2Q3USJ8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Fchsd2Q3USJ8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Fchsd2Q3USJ8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Fchsd2Q3USJ8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Fchsd2Q3USJ8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Fchsd2Q3USJ8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms