Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rnf224Q3UIW8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf224Q3UIW8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf224Q3UIW8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf224Q3UIW8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf224Q3UIW8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf224Q3UIW8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf224Q3UIW8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf224Q3UIW8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf224Q3UIW8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf224Q3UIW8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf224Q3UIW8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf224Q3UIW8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf224Q3UIW8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf224Q3UIW8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf224Q3UIW8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf224Q3UIW8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf224Q3UIW8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf224Q3UIW8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf224Q3UIW8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf224Q3UIW8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf224Q3UIW8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf224Q3UIW8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf224Q3UIW8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf224Q3UIW8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf224Q3UIW8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf224Q3UIW8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf224Q3UIW8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf224Q3UIW8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf224Q3UIW8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf224Q3UIW8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf224Q3UIW8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf224Q3UIW8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf224Q3UIW8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf224Q3UIW8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf224Q3UIW8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf224Q3UIW8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf224Q3UIW8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf224Q3UIW8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf224Q3UIW8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf224Q3UIW8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf224Q3UIW8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf224Q3UIW8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf224Q3UIW8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf224Q3UIW8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf224Q3UIW8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf224Q3UIW8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf224Q3UIW8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf224Q3UIW8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf224Q3UIW8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf224Q3UIW8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf224Q3UIW8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf224Q3UIW8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf224Q3UIW8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf224Q3UIW8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf224Q3UIW8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf224Q3UIW8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf224Q3UIW8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf224Q3UIW8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf224Q3UIW8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf224Q3UIW8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf224Q3UIW8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf224Q3UIW8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf224Q3UIW8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf224Q3UIW8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms