Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI43

Babam1, BRISC and BRCA1-A complex member 1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Babam1Q3UI43 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Babam1Q3UI43 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Babam1Q3UI43 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Babam1Q3UI43 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Babam1Q3UI43 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Babam1Q3UI43 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Babam1Q3UI43 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Babam1Q3UI43 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Babam1Q3UI43 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Babam1Q3UI43 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Babam1Q3UI43 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Babam1Q3UI43 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Babam1Q3UI43 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Babam1Q3UI43 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Babam1Q3UI43 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Babam1Q3UI43 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Babam1Q3UI43 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Babam1Q3UI43 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Babam1Q3UI43 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Babam1Q3UI43 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Babam1Q3UI43 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Babam1Q3UI43 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Babam1Q3UI43 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Babam1Q3UI43 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Babam1Q3UI43 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Babam1Q3UI43 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Babam1Q3UI43 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Babam1Q3UI43 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Babam1Q3UI43 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Babam1Q3UI43 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Babam1Q3UI43 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Babam1Q3UI43 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Babam1Q3UI43 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Babam1Q3UI43 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Babam1Q3UI43 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Babam1Q3UI43 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Babam1Q3UI43 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Babam1Q3UI43 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Babam1Q3UI43 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Babam1Q3UI43 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Babam1Q3UI43 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Babam1Q3UI43 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Babam1Q3UI43 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Babam1Q3UI43 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Babam1Q3UI43 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Babam1Q3UI43 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Babam1Q3UI43 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Babam1Q3UI43 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Babam1Q3UI43 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Babam1Q3UI43 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Babam1Q3UI43 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Babam1Q3UI43 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Babam1Q3UI43 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Babam1Q3UI43 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Babam1Q3UI43 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Babam1Q3UI43 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Babam1Q3UI43 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Babam1Q3UI43 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Babam1Q3UI43 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Babam1Q3UI43 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Babam1Q3UI43 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Babam1Q3UI43 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Babam1Q3UI43 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Babam1Q3UI43 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Babam1Q3UI43 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Babam1Q3UI43 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Babam1Q3UI43 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Babam1Q3UI43 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Babam1Q3UI43 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Babam1Q3UI43 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Babam1Q3UI43 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Babam1Q3UI43 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Babam1Q3UI43 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Babam1Q3UI43 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Babam1Q3UI43 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Babam1Q3UI43 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Babam1Q3UI43 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Babam1Q3UI43 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Babam1Q3UI43 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Babam1Q3UI43 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Babam1Q3UI43 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Babam1Q3UI43 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Babam1Q3UI43 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Babam1Q3UI43 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Babam1Q3UI43 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Babam1Q3UI43 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Babam1Q3UI43 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Babam1Q3UI43 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Babam1Q3UI43 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Babam1Q3UI43 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Babam1Q3UI43 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Babam1Q3UI43 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Babam1Q3UI43 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Babam1Q3UI43 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Babam1Q3UI43 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms